Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TpoP35419 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TpoP35419 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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TpoP35419 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TpoP35419 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TpoP35419 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TpoP35419 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TpoP35419 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TpoP35419 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TpoP35419 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TpoP35419 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TpoP35419 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms