Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms