Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PdgfraP26618 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PdgfraP26618 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PdgfraP26618 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PdgfraP26618 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms