Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms