Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RarbP22605 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RarbP22605 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RarbP22605 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RarbP22605 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RarbP22605 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RarbP22605 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RarbP22605 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RarbP22605 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RarbP22605 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RarbP22605 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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