Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TP20293 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
TP20293 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TP20293 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TP20293 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TP20293 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TP20293 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TP20293 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TP20293 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TP20293 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TP20293 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TP20293 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TP20293 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TP20293 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms