Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NefhP19246 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NefhP19246 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms