Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18529 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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P18529 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms