Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18526 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18526 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18526 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18526 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18526 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18526 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18526 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18526 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18526 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms