Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P10404 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms