Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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H2-Eb1P04230 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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H2-Eb1P04230 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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H2-Eb1P04230 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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H2-Eb1P04230 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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