Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-K1P01901 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms