Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01804 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01804 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01804 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01804 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01804 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01804 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01804 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01804 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01804 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01804 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01804 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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