Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms