Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Stra6O70491 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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