Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ctnnd2O35927 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnd2O35927 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms