Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms