Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Foxd2O35392 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Foxd2O35392 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Foxd2O35392 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Foxd2O35392 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Foxd2O35392 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxd2O35392 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.2 ms