Protein–RNA interactions for Protein: O35199

Vmn2r89, Putative pheromone receptor, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r89O35199 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vmn2r89O35199 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vmn2r89O35199 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vmn2r89O35199 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Vmn2r89O35199 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Vmn2r89O35199 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn2r89O35199 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Vmn2r89O35199 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Vmn2r89O35199 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Vmn2r89O35199 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Vmn2r89O35199 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Vmn2r89O35199 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms