Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casq1O09165 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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