Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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MttpO08601 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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MttpO08601 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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MttpO08601 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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MttpO08601 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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MttpO08601 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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MttpO08601 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MttpO08601 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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MttpO08601 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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