Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms