Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms