Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm5294J3QP53 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm5294J3QP53 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm5294J3QP53 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm5294J3QP53 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm5294J3QP53 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm5294J3QP53 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm5294J3QP53 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm5294J3QP53 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm5294J3QP53 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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