Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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