Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms