Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Myo5cE9Q1F5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms