Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms