Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prrt4B2RU40 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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