Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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