Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms