Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms