Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PdfS4R2K0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms