Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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CcniQ9Z2V9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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