Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms