Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn8Q9Z260 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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