Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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