Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ripk3Q9QZL0 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ripk3Q9QZL0 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ripk3Q9QZL0 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ripk3Q9QZL0 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ripk3Q9QZL0 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ripk3Q9QZL0 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ripk3Q9QZL0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ripk3Q9QZL0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ripk3Q9QZL0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ripk3Q9QZL0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ripk3Q9QZL0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.6 ms