Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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