Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms