Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms