Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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