Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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