Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms