Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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