Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trmt44Q9D2Q2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trmt44Q9D2Q2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms