Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Snapc3Q9D2C9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Snapc3Q9D2C9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Snapc3Q9D2C9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Snapc3Q9D2C9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Snapc3Q9D2C9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Snapc3Q9D2C9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Snapc3Q9D2C9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms