Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1lQ9D1E5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms