Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms