Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms